新北幼兒園群聚案，雖然基因定序雖然尚未出爐，但矛頭已指向Delta變異株。然而指揮中心指揮官陳時中記者會時仍表示，目標仍是將第一劑涵蓋率拉高，不會加快第二劑接種。台大兒童醫院院長黃立民表示，面對Delta變異株，只打一劑疫苗的保護力可能從七、八成掉到三、四成；如此一來，「第一劑疫苗就等於白打了」。
黃立民表示，國內因為疫苗不夠，所以只能選一條路走，不是拉高第一劑覆蓋率，就是盡快讓高風險族群打第二劑；「顯然指揮中心選了第一條路」。既然如此，指揮中心就得承擔這個選擇的風險。
他表示，只打一劑雖然對Alpha的效果很好，但面對Delta變異株就不成立了，保護力可能從七、八成掉到三、四成。如此一來，疫苗喪失了對重症、死亡的預防效果，「第一劑疫苗就等於白打了」。
中國附醫副院長黃高彬則表示，目前最主要還是得先確認流行的病毒株，若這次幼兒園群聚最後定序為Delta變異株，但國內流行的病毒株仍為Alpha，且群聚感染對象皆為幼童和年輕父母的話，其實維持拉高第一劑覆蓋率，讓民眾有基本保護力較好。
不過，若此次群聚定序出Delta變異株且向外擴散至年紀較長的高危險群，建議指揮中心儘快針對長者、具慢性病等高危險族群，規劃第二劑接種為宜，如此才能有效避免重症和死亡的發生。
